Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms