Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem53Q9D0Z3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms