Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2e1Q9D0D5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms