Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snw1Q9CSN1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms