Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms