Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
PsenenQ9CQR7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PsenenQ9CQR7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms