Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Nicn1Q9CQM0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Nicn1Q9CQM0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Nicn1Q9CQM0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Nicn1Q9CQM0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Nicn1Q9CQM0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Nicn1Q9CQM0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nicn1Q9CQM0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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