Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Use1Q9CQ56 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms