Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nup155Q99P88 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms