Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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