Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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