Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms