Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms