Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FgbQ8K0E8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms