Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pramef8Q8CE24 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pramef8Q8CE24 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pramef8Q8CE24 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms