Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp54Q8BL06 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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