Protein–RNA interactions for Protein: Q80XG9

Lrrtm4, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 4, mousemouse

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm4Q80XG9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrrtm4Q80XG9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrrtm4Q80XG9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrrtm4Q80XG9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lrrtm4Q80XG9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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