Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

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Length 3,461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RelnQ60841 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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RelnQ60841 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RelnQ60841 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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