Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms