Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trim58Q5NCC9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim58Q5NCC9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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