Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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D13Ertd608eQ3UPR8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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D13Ertd608eQ3UPR8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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