Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms