Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Jmjd8Q3TA59 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Jmjd8Q3TA59 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Jmjd8Q3TA59 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Jmjd8Q3TA59 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Jmjd8Q3TA59 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms