Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms