Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms