Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cntnap5cQ0V8T7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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