Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TrioQ0KL02 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms