Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.2 ms