Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
MitfQ08874 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms