Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cxcr5Q04683 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms