Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms