Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms