Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UbdP63072 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UbdP63072 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UbdP63072 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UbdP63072 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
UbdP63072 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
UbdP63072 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms