Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms