Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube2kP61087 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms