Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 960 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms