Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VdrP48281 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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VdrP48281 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VdrP48281 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
VdrP48281 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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