Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TgfaP48030 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TgfaP48030 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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