Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrprbP47758 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrprbP47758 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms