Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtgfrP43117 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtgfrP43117 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtgfrP43117 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtgfrP43117 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtgfrP43117 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtgfrP43117 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtgfrP43117 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtgfrP43117 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PtgfrP43117 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtgfrP43117 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms