Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf9P41274 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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