Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PdgfraP26618 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PdgfraP26618 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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