Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Hoxd12P23812 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms