Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PrkchP23298 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms