Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RarbP22605 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RarbP22605 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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