Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms