Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Fcer1aP20489 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Fcer1aP20489 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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