Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NefhP19246 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NefhP19246 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NefhP19246 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NefhP19246 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NefhP19246 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NefhP19246 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NefhP19246 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NefhP19246 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms