Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Defa-rs1P17533 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Defa-rs1P17533 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Defa-rs1P17533 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Defa-rs1P17533 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Defa-rs1P17533 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa-rs1P17533 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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