Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P10404 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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P10404 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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P10404 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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P10404 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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P10404 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P10404 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
P10404 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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